颜色是关于宝石最引人注目的因素。然而，单单颜色并不是识别和分类宝石的方法。所有宝石都有独特的晶体结构和典型的物理和光学特性。

天然、透明的宝石通常是矿物。矿物可按种类、品种分类，有时也可按组别分类。 

矿物种类是由其共同的化学成分和晶体结构来定义的。矿物种类的例子包括绿柱石、刚玉和石英。品种是物种的一个细分，是基于颜色、透明度或现象（星光、聊斋、玩色）。矿物品种的例子包括绿宝石、红宝石和黄水晶。一个组由两个或更多的矿物品种组成，它们在化学成分、晶体结构和属性方面都很相似。有些宝石不是矿物，因为它们是有机宝石（珍珠）或不是天然的。  

贝里尔

绿宝石, 海蓝宝石, 摩根石

祖母绿是最流行和知名的绿柱石品种，其次是海蓝宝石和摩根石。还有一些不太知名的品种，如Heliodor（黄色）、Maxixe（蓝色）和红柱石。  

刚玉

红宝石，蓝宝石

红宝石和蓝宝石构成了刚玉品种，是最受欢迎的两种宝石之一。红宝石是刚玉的红色品种，而蓝宝石则有彩虹般的颜色，其中蓝色蓝宝石最受欢迎。  

电气石

碧玺是商业上最重要的宝石之一，有多种颜色。碧玺有鲜艳的颜色，从丰富的红色到柔和的粉红色，强烈的绿色，深蓝色和生动的黄色。帕拉伊巴碧玺是含铜碧玺，有霓虹灯般的蓝色和绿色。它们要求的每克拉价格是宝石中最高的之一。  

石榴石

与碧玺一样，石榴石也属于同一矿物群，具有相同的晶体结构，但化学成分略有不同，这使它具有不同的颜色。宝石中最重要的石榴石种类是。石榴石、金刚砂、天青石、毛石和安得烈石。石榴石品种的一些例子包括。 

蛋白石

蛋白石以其鼓舞人心的色彩游戏而闻名，这是因为白光与其有序的内部分子结构相互作用而产生的。蛋白石有许多类型，按其背景（体色）颜色分类。常见的蛋白石类型有黑蛋白石、白蛋白石、水蛋白石、火蛋白石和巨石蛋白石。  

坦桑石

坦桑石于1967年由坦桑尼亚梅拉尼山的一个马赛部落的人首次发现。它的名字是由蒂芙尼公司命名的，灵感来自它被发现的国家。自从它被发现和大力推广以来，坦桑石已成为最受欢迎的宝石之一。

尖晶石

历史上，许多宝石被误认为是红宝石，但后来被确认为尖晶石。尖晶石有各种颜色，从红色、粉红色到紫色、蓝色和蓝绿色。  

铬钴矿

亚历山大石，猫眼石，金绿宝石

亚历山大石和猫眼金绿宝石是金绿宝石品种中最罕见和最受欢迎的两个现象级品种。亚历山大石以其变色现象而闻名，而猫眼金绿宝石则显示出壮观的闲逛性（猫眼）。  

翡翠

几千年来，翡翠一直是一种珍贵的宝石，特别是在亚洲。翡翠有各种颜色，但绿色是最受欢迎和最有价值的。  

有机宝石

珊瑚，珍珠

有机宝石是指从生物中提取的宝石，即从植物或动物中提取。例子包括珍珠和珊瑚。由于有机宝石来自植物或动物，环境问题导致了一个名为CITES的全球条约。其目的是为了保护环境，使其免受无管制的贸易。